IMP型金属β-内酰胺酶活性中心的计算机模拟分析

作     者：许岩 余江河 郑珩 劳兴珍 吕品一 Xu Yan;Yu Jiang-he;Zheng Heng;Lao Xing-zhen;Lu Pin-yi

作者机构：中国药科大学药物生物信息学教研室南京210009 

出 版 物：《中国抗生素杂志》 (Chinese Journal of Antibiotics)

年 卷 期：2009年第34卷第9期

页      码：543-547页

摘      要：应用信息论方法和计算机模拟的方法,对IMP型β-内酰胺酶序列及活性中心进行分析,结果表明在配体结合部位的大部分残基是高度保守的,但也有部分残基易发生变异,如32位Pro、31位Val和163位Try,这些变异是引起该酶不同变异型对β-内酰胺类抗生素水解能力不同的重要原因,在设计抑制剂时需考虑在酶高变区附近分子的柔性,以防出现新突变型而对所设计抑制剂产生抗性。将酶和底物亚胺培南及青霉素G对接结果表明,底物与酶的结合自由能与酶的催化活性间有很好的相关性,可作为评估底物或酶抑制剂结合能力的重要评价指标。对接模型更细致地显示了酶中与底物相互作用的氨基酸残基,为酶抑制剂的合理设计奠定了基础。

主 题 词：IMP 金属β-内酰胺酶 香农熵 同源模建 分子对接 

学科分类：1007[医学-药学类] 100705[100705] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.13461/j.cnki.cja.004452

馆 藏 号：203364006...