Ezrin蛋白mRNA的一、二级结构分析和反义技术作用靶点设计

作     者：王姚斐 沈靖南 王晋 黄纲 谢显彪 尹军强 邹昌业 WANG Yao-fei;SHEN Jing-nan;WANG Jin;HUANG Gang;XIE Xian-biao;YIN Jun-qiang;ZOU Chang-ye

作者机构：中山大学附属第一医院骨肿瘤科广东广州510080 

基　　金：高等学校博士学科点专项科研基金(No:20060558018) 

出 版 物：《中国现代医学杂志》 (China Journal of Modern Medicine)

年 卷 期：2011年第21卷第4期

页      码：377-383,388页

摘      要：目的分析肿瘤远处转移相关蛋白Ezrin mRNA的一、二级结构,寻找其各种反义技术作用的靶点。方法利用RNAdraw和RNAstructure两种计算机程序对Ezrin mRNA进行分析计算,得到其一、二级结构信息,选择两种程序计算出的共同的连续4个以上碱基未配对的单链成环区作为反义技术的靶区域,设计反义寡核苷酸(AsODNs)、核酶(Ribozyme)、脱氧核酶(DNAzyme or Deoxyribozyme)和小干扰RNA(SiRNA)等4种常用反义技术的作用靶点,再通过计算机程序OligoWalk利用最低自由能原则进行筛选,最后得到各反义技术的作用靶点。结果各反义技术的靶点数目分别为:AsODNs17个,Ribozyme5个,DNAzyme15个,SiR-NA10个;其中AsODNs靶点中较为理想的为G1749-A1771和C1777-G1794,Ribozyme为A2359-G2360,DNAzyme为A1789-U1790、A1756-G1757及A1784-G1785,SiRNA为G802-G808、G1749-A1771及A2354-G2360,并且A2354-G2360是所有4种反义技术共同的作用区域,可以作为一个通用靶点。结论正确的靶点设计为应用反义技术抑制Ezrin表达从而控制恶性肿瘤的远处转移提供了有效的指导作用。

主 题 词：Ezrin 二级结构 反义技术 靶点 

学科分类：1002[医学-临床医学类] 100214[100214] 10[医学] 

馆 藏 号：203364624...