CODEHOP法设计简并引物克隆花羔红点鲑β-肌动蛋白基因及生物信息分析

作     者：卢玉婷 张雅斌 吉尚雷 王建超 郑伟 张培军 李月红 LU Yu-ting;ZHANG Ya-bin;JI Shang-lei;WANG Jian-chao;ZHENG Wei;ZHANG Pei-jun;LI Yue-hong

作者机构：吉林农业大学动物科学学院吉林长春130118 吉林省水产科学研究院吉林长春130000 吉林省卫生监测检验中心吉林长春130000 

基　　金：国家自然科学基金(30972191) 农业部948项目(2014Z43) 吉林省教育厅"十二五"科学技术研究重点项目(201486) 

出 版 物：《中国畜牧杂志》 (Chinese Journal of Animal Science)

年 卷 期：2014年第50卷第15期

页      码：10-14页

摘      要：本研究克隆了花羔红点鲑β-肌动蛋白基因,结合生物信息学资源和生物软件的使用,利用CODEHOP法针对特定的氨基酸序列设计简并引物,克隆结果进行同源性分析并构建系统进化树。结果表明:应用此种方法设计出的引物简并度相对较低,Tm值的修改较为灵活,产物特异性强;/3-肌动蛋白具有高度的保守性,比对结果与虹鳟同源性达99.8%,与大马哈鱼同源性达99.3%,与大西洋鲑同源性达99.8%,系统发育关系与传统的分类相一致。

主 题 词：简并引物 CODEHOP β-肌动蛋白 

学科分类：090801[090801] 0908[0908] 09[农学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.0258-7033.2014.15.003

馆 藏 号：203366366...