小麦RING型E3泛素连接酶基因TaSDIR1-D克隆与功能分析

作     者：王瑞同 王景一 毛新国 昌小平 刘惠民 景蕊莲 WANG Rui-tong;WANG Jing-yi;MAO Xin-guo;CHANG Xiao-ping;LIU Hui-min;JING Rui-lian

作者机构：山西大学生物工程学院太原030000 中国农业科学院作物科学研究所北京100081 

基　　金：国家自然科学基金(31271720) 中国农业科学院科技创新工程协同创新任务(CAAS-XTCX2016019) 

出 版 物：《植物遗传资源学报》 (Journal of Plant Genetic Resources)

年 卷 期：2018年第19卷第5期

页      码：951-958页

摘      要：具有RING结构域的E3泛素连接酶SDIR1(Salt-and drought induced really interesting new gene finger1)在植物信号调节通路中发挥着重要的作用。本研究克隆得到小麦TaSDIR1-D基因,基因组序列全长4070 bp,其中编码区上游为1443 bp,编码区为2352 bp,3 端非编码区(UTR)为275 bp;该基因编码区cDNA序列长度为849 bp,预测其编码282个氨基酸,包括2个跨膜结构域和1个保守的RING型finger结构域。以野生近缘种的二倍体、四倍体和六倍体普通小麦及一套由中国春为背景的缺-四体为材料,将基因定位在染色体4D上;小麦抽穗期TaSDIR1-D在旗叶中的表达量最高;在NaCl、ABA、PEG及4℃非生物胁迫诱导下,小麦TaSDIR1-D均上调表达,可能参与植物抗逆调节通路;通过检测32份多态性较高的小麦材料TaSDIR1-D基因序列多态性,共检测到2个SNP,基因的编码区和上游序列中各存在1个核苷酸变异,其中编码区的核苷酸变异位点(G/A)位于第4外显子上,为非同义突变,使精氨酸(Agr)变为组氨酸(His)。2个SNP组成两种单倍型,根据-583 bp处的SNP(T/C)设计分子标记SNP-583,扫描自然群体262份材料的基因型,将其分为2种单倍型,分别与千粒重、倒二节长和穗长显著相关或极显著相关,单倍型Hap-4D-2为提高千粒重的优异单倍型。研究结果为小麦分子育种提供了理论依据和基因资源。

主 题 词：TaSDIR1-D RING型E3泛素连接酶 抗逆性 分子标记 关联分析 

学科分类：09[农学] 0901[农学-植物生产类] 

核心收录：

D　O　I：10.13430/j.cnki.jpgr.20180309002

馆 藏 号：203369426...