番茄枯萎病菌基因组微卫星位点分析与引物设计

作     者：罗梅 李书锋 罗媛子 王嘉熠 董章勇 LUO Mei;LI Shufeng;LUO Yuanzi;WANG Jiajie;DONG Zhangyong

作者机构：仲恺农业工程学院农业与生物学院广东广州510225 

基　　金：国家自然科学基金(31301627) 广东省大学生创新创业训练计划(201511347058)资助项目 

出 版 物：《仲恺农业工程学院学报》 (Journal of Zhongkai University of Agriculture and Engineering)

年 卷 期：2018年第31卷第3期

页      码：15-19页

摘      要：通过对前期测定的番茄枯萎病菌Fusarium oxysporum f. sp. lycopersic基因组14 501条gene序列进行搜索,发现466个简单重复序列(Simple sequence repeat,SSR)分布在425条unigenes中,发生频率为2. 93%.在番茄枯萎病基因组的SSR中,三核苷酸重复占主导地位,占SSR总数的65. 88%.优势重复单元为AGC/CTG和AAG/CTT,分别占16. 52%和12. 66%.基于筛选的SSRs,运用Primer3软件进行引物的批量设计,共设计出451对引物.结果说明番茄枯萎病菌基因组中含有丰富的SSR位点.

主 题 词：番茄枯萎病 基因组 简单重复序列 微卫星DNA 引物 

学科分类：09[农学] 0904[农学-动物医学类] 090401[090401] 090402[090402] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1674-5663.2018.03.003

馆 藏 号：203377017...