人ID4基因启动子及上游顺式表达调控元件的克隆及特征分析

作     者：黄玉 李薇 迟小华 刘丽宏 张峰 党艳辉 杨波 卢学春 HUANG Yu;LI Wei;CHI Xiao-hua;LIU Li-hong;ZHANG Feng;DANG Yan-hui;YANG Bo;LU Xue-chun

作者机构：解放军总医院南楼血液科北京100853 吉林大学第一医院血液肿瘤中心 解放军第二炮兵总医院药剂科北京100800 中国科学院北京基因组研究所北京100029 

基　　金：国家自然科学基金(30873086、30772597) 

出 版 物：《解放军医学杂志》 (Medical Journal of Chinese People's Liberation Army)

年 卷 期：2010年第35卷第2期

页      码：151-154页

摘      要：目的克隆人ID4基因启动子及上游顺式调控元件,并对其结构及调控元件的特征进行生物信息学分析。方法从NCBI人类基因组数据库中截取ID4基因转录起始位点上游5′侧翼区约2242bp及下游5′非翻译区212bp的基因组序列。利用TESS和Genomax等在线分析软件进行启动子及上游调控元件的特征分析。设计PCR引物,采用分段扩增法,获得长度分别为1811bp和650bp的两条产物片段,分别插入pGEM-T载体,转化至Top10感受态大肠埃希菌,筛选阳性克隆。先后应用KpnⅠ/NheⅠ、KpnⅠ/EcoRⅠ对获得的两个pGEM-T重组载体及pGL3Basic荧光素酶报告载体进行双酶切,T4DNA连接酶连接,转化至Top10感受态大肠埃希菌,筛选阳性克隆,最后测序鉴定。结果获得长度为2461bp的ID4基因启动子DNA序列,经测序证实与人类基因组序列一致。ID4基因具有Ⅱ型启动子特征,有2个非常显著的上游元件(TATA盒和GC盒),GC含量占总碱基含量的65.9%。在转录起始位点上游-1000bp与下游212bp之间分别存在多个可能具有正向和负向调控作用的顺式元件。结论成功克隆了人ID4基因启动子及其顺式调控元件,并证明ID4基因具有典型的Ⅱ型启动子结构。筛选出3个最有可能对ID4表达起调控作用的顺式元件,分别为糖皮质激素受体、单磷酸腺苷(cAMP)结合蛋白受体及雌激素受体。

主 题 词：ID4蛋白,人 转录启动子 人工基因融合 计算生物学 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 071007[071007] 

核心收录：

馆 藏 号：203379576...