牛樟EST-SSR标记的开发及遗传多态性分析

作     者：郭莺 孟红岩 林文珍 林志楷 刘黎卿 GUO Ying;MENG Hongyan;LIN Wenzhen;LIN Zhikai;LIU Liqing

作者机构：福建省亚热带植物研究所福建厦门361006 

基　　金：厦门市对台科技合作项目(No.3502Z20182007 No.3502Z20161234 No.3502Z20131150) 

出 版 物：《热带作物学报》 (Chinese Journal of Tropical Crops)

年 卷 期：2018年第39卷第8期

页      码：1561-1569页

摘      要：本研究通过测序牛樟叶片cDNA获得17 046条Uni-EST,从中检测出1 316个SSR位点,平均每25.7 kb EST含1个SSR位点。功能注释发现1242条SSR-EST中有690条可被划分为3大功能类、18个功能亚类。牛樟EST-SSR二核苷酸重复类型出现频率最高,三核苷酸次之。184类重复基序中AG/CT出现频率最高(32.4%),其次为AAG/CTT(9.3%)。从1 242条SSR-EST设计SSR引物537对,随机选取150对检测牛樟的多态性及在香樟、大叶樟和沉水樟中的可转移性。结果表明,有44对引物在牛樟中得到特异性扩增,其中17对具有多态性,检测出的等位基因数2~7个,平均3.02个。牛樟SSR标记在香樟、沉水樟和大叶樟的可转移率分别为97.7%、97.7%和95.3%。聚类分析表明,在遗传相似系数为0.76处,14个樟属植物能被划分为5类,聚类结果与植物学分类结果基本吻合。

主 题 词：牛樟 EST-SSR 标记开发 遗传多态性 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 071001[071001] 07[理学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1000-2561.2018.08.014

馆 藏 号：203380433...