采用分子动力学模拟探究VWF-A1突变体G561S的亲和力变化机制

作     者：李红 刘文平 刘广建 吴建华 方颖 LI Hong;LIU Wen-ping;LIU Guang-jian;WU Jian-hua;FANG Ying

作者机构：华南理工大学生物科学与工程学院广州510006 

基　　金：国家自然科学基金项目(11272125 11432006 31170887) 

出 版 物：《医用生物力学》 (Journal of Medical Biomechanics)

年 卷 期：2015年第30卷第5期

页      码：433-439页

摘      要：目的探究血管性血友病因子(von Willebrand factor,VWF)突变体G561S下调VWF-A1与其配体亲和力的分子机制。方法分别构建2M型突变体G561S-A1(功能减弱型)、WT-A1(野生型)和2B型突变体R543Q-A1(功能增强型)3个分子系统。G561S-A1突变体采用将野生型A1结构的Gly561替换为Ser561的方式构建,WT-A1与R543Q-A1晶体结构取自蛋白质数据库(protein data bank,PDB)。利用自由分子动力学模拟方法对比分析WT-A1、G561S-A1、R543Q-A1三者构象的改变、柔性的变化以及氢键/盐桥的形成与演化。结果 G561S突变通过降低A1结构域α2螺旋的柔性,并增强N末端与body区的相互作用从而减弱其与配体GPIbα的亲和力,R543Q功能增强型突变体则启动了一条相反的调节路径。结论局部动力学性质的改变是A1亲和力调控的潜在机制,研究结果有助于针对激活的A1结构域的变构药物设计以及相关抗血栓药物的研发。

主 题 词：血管性血友病因子 亲和力 分子动力学 

学科分类：0831[工学-公安技术类] 08[工学] 0836[0836] 

核心收录：

D　O　I：10.3871/j.1004-7220.2015.05.433

馆 藏 号：203382245...