禽流感病毒广东株HA基因BLSOM神经网络分型方法的建立

作     者：田纯见 罗琼 高佳卉 林志雄 鱼海琼 刘志玲 陈茹 吴晓薇 

作者机构：广东出入境检验检疫局检验检疫技术中心/广东省动植物与食品进出口技术措施研究重点实验室/国家质量监督与检验检疫总局国家禽流感检测重点实验室.广东广东广州510623 

基　　金：国家出入境检验检疫科研项目(2015IK054) 科技部国家重大科学仪器设备开发专项(2012YQ09019705) 

出 版 物：《广东农业科学》 (Guangdong Agricultural Sciences)

年 卷 期：2016年第43卷第2期

页      码：156-160页

摘      要：利用25个禽流感病毒及相关流感病毒广东株HA基因序列,建立三、四核苷酸特征基因片段BLSOM神经网络分型方法,对各片段数量进行统计和归一化处理。设计程序由MATLAB函数模拟人脑思维自组织学习,当训练步数为100及以上各毒株能成功聚类。H1、H3、H5、H7和H9亚型主要毒株分别归为一类,其中H3N2和H7N9毒株HA基因聚类图谱高度相似,表明这些毒株起源相同;不同年代H5N1毒株差异较大;H1N1和H9N2各1个毒株聚为一类,表明这两种病毒自然重组变异,为高危毒株筛查和溯源提供参考。

主 题 词：禽流感病毒 BLSOM HA基因 神经网络 分型 

学科分类：090603[090603] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1004-874X.2016.02.029

馆 藏 号：203382459...