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基于苹果基因组开发梨的多态性SSR引物

基于苹果基因组开发梨的多态性SSR引物

作     者:关玲 黄金凤 刘金义 高志红 章镇 乔玉山 GUAN Ling;HUANG Jin-feng;LIU Jin-yi;GAO Zhi-hong;ZHANG Zhen;QIAO Yu-shan

作者机构:南京农业大学园艺学院南京210095 教育部园艺作物种质创新与利用工程研究中心南京210095 

基  金:国家高技术研究与发展计划重点项目(2006AA100108) 

出 版 物:《西北植物学报》 (Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica)

年 卷 期:2012年第32卷第1期

页      码:48-53页

摘      要:从NCBI网站获取‘金冠’苹果基因组数据,在每条染色体上随机设计4对共68对引物。利用梨品种‘黄冠’和‘莱阳茌梨’及其F1代杂交群体(共94个单株)对这些引物的应用性进行验证,同时分析了该群体遗传多样性。(1)引物扩增结果显示,有40对引物可以扩增出预期目的条带,占设计引物数量的58.82%,其中16对引物能够扩增出多态性条带。(2)群体遗传多样性分析结果显示,有16对多态性引物扩增产物的等位基因数平均为2.312 5,有效等位基因数平均为2.001 4,平均杂合度观测值、期望杂合度和香农指数分别为0.548 3、0.490 5和0.746 2,表明可以在梨上运用。研究证明,SSR位点在苹果与梨之间可以转移应用。

主 题 词: SSR 引物 苹果 基因组 

学科分类:07[理学] 0713[0713] 

核心收录:

D O I:10.3969/j.issn.1000-4025.2012.01.008

馆 藏 号:203386538...

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