SET区域Rubisco赖氨酸甲基化转移酶催化赖氨酸多重甲基化的量子力学研究

作     者：蒋彦可 邹建卫 卢运祥 蒋勇军 俞庆森 Jiang,Yanke;Zou,Jianwei;Lu,Yunxiang;Jiang,Yongjun;Yu,Qingsen

作者机构：浙江大学化学系杭州310027 浙江大学宁波理工学院分子设计与营养工程重点实验室宁波315104 

出 版 物：《化学学报》 (Acta Chimica Sinica)

年 卷 期：2009年第67卷第5期

页      码：372-380页

摘      要：用从头计算和DFT方法计算S-腺苷甲锍氨酸多重甲基化赖氨酸的反应机理.气相中非催化反应的能垒比较低,反应势能剖面类似于SN2反应,而在电介质中,反应能垒很高.在B3LYP/6-31G*和ONIOM(MP2:B 3LYP)水平,研究了Rubisco大亚基甲基转移酶活性位点的三个残基催化转移甲基到赖氨酸反应的过程.在ONIOM(MP2:B3LYP)水平,预测的反应能垒为82.8kJ/mol,与从实验得到的87.4kJ/mol接近.计算结果表明,酶对过渡态并没有特殊的稳定作用,主要通过为反应物提供一个没有溶剂的环境,用临近的残基把亲电和亲核的底物连接在一起,进而促使甲基化反应的进行.

主 题 词：赖氨酸甲基化 甲基化转移酶 S-腺苷甲锍氨酸 洋葱算法 从头计算 

学科分类：081704[081704] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 070303[070303] 0703[理学-化学类] 

核心收录：

D　O　I：10.3321/j.issn:0567-7351.2009.05.004

馆 藏 号：203387085...