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中度嗜盐菌GbsB基因的克隆、序列分析及生物信息学分析

中度嗜盐菌GbsB基因的克隆、序列分析及生物信息学分析

作     者:赵建朋 康壮丽 郝凤霞 胡文革 ZHAO Jian-peng;KANG Zhang-li;HAO Feng-xia;HU Wen-ge

作者机构:石河子大学生命科学学院新疆石河子832003 

出 版 物:《石河子大学学报(自然科学版)》 (Journal of Shihezi University(Natural Science))

年 卷 期:2008年第26卷第5期

页      码:557-561页

摘      要:为构建耐盐的转基因植物提供材料,根据地衣芽孢杆菌Bacillus licheniformisATCC 14580的GbsB基因的核甘酸序列设计1对特异性引物,通过PCR的方法扩增由分离的中度嗜盐菌Bacillus ***1-05的GbsB基因,经T/A克隆,插入到pBS-T载体上进行序列测序,采用NCBI-BlastX软件在Genbank数据库中进行同源性检索,结果表明:得到的GbsB基因的开放阅读框(ORF)全长为1209bp,编码1个由402个氨基酸残基组成的蛋白质;其与Bacillus licheni-formisATCC 14580的GbsB基因的氨基酸序列同源性高达96%。生物信息学分析表明:该GbsB基因编码蛋白无信号肽,无跨膜区域,高亲水性,有2个乙醇脱氢酶作用位点。

主 题 词:中度嗜盐菌 乙醇脱氢酶基因 克隆 序列分析 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 1007[医学-药学类] 100705[100705] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 071005[071005] 090102[090102] 10[医学] 

D O I:10.3969/j.issn.1007-7383.2008.05.009

馆 藏 号:203388045...

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