口蹄疫病毒G-01株基因组编码区的序列分析

作     者：索青利 赵明秋 陈金顶 陈立军 黄忠强 SUO Qing-li;ZHAO Ming-qiu;CHEN Jin-ding;CHEN Li-jun;HUANG Zhong-qiang

作者机构：华南农业大学兽医学院广东广州510642 

基　　金：广东省自然科学基金(02099506025827) 广东省科技计划项目(2005B20201006) 广东省自然科学基金创新团队项目(5200638) 

出 版 物：《华南农业大学学报》 (Journal of South China Agricultural University)

年 卷 期：2007年第28卷第4期

页      码：95-99页

摘      要：参考GenBank中注册的O型口蹄疫病毒（FMDV）全基因序列,分段设计了9对引物,应用RT-PCR方法对G-01株的基因组编码区序列进行了克隆和序列测定,获得了该毒株基因组编码区的核苷酸序列（6966 bp）并推导出其编码的氨基酸序列（2322 aa）.将获得的G-01株基因组编码区的核苷酸序列与参考的14株FMDV基因序列进行比较,结果表明,本毒株的3A蛋白的92～101位缺失10 aa,VP1基因的133～160位的关键位点没有变化,该毒株与以HKN/2002株为代表的7株O型毒株的同源性较高,与HKN/2002株遗传关系最近,而与另外7株O型毒株同源性较低,其遗传关系也较远.由此推断G-01与HKN/2002株属于遗传关系较近的毒株,这2株病毒有着相同的进化起源.

主 题 词：口蹄疫病毒 基因组编码区 序列分析 

学科分类：090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

核心收录：

D　O　I：10.3969/j.issn.1001-411X.2007.04.023

馆 藏 号：203394081...