应用液滴数字PCR技术检测rs6983267三种多态性位点

作     者：沈阳丽 孙浩 蔡文臣 张品正 王旭莹 尚雨寒 石璐 辛倩倩 郭志义 SHEN Yang-Li;SUN Hao;CAI Wen-Chen;ZHANG Pin-Zheng;WANG Xu-Ying;SHANG Yu-Han;SHI Lu;X[1N Qian-Qian];GUO Zhi-Yi

作者机构：华北理工大学医学实验研究中心唐山063000 

基　　金：国家自然科学基金(31050010) 教育部归国留学基金(No.311) 河北省归国留学人员择优资助项目(C201400358) 华北理工大学大学生创新创业计划(X2015052 X2016121)资助项目 

出 版 物：《生物化学与生物物理进展》 (Progress In Biochemistry and Biophysics)

年 卷 期：2018年第45卷第11期

页      码：1160-1165页

摘      要：核苷酸的多态性检测在临床以及基础生命科学研究中占据着重要地位.目前基于PCR的探针法应用最为广泛.由于在核苷酸上微小差异,探针的设计往往带有交叉活性反应,这阻碍了qPCR方法的推广.数字PCR(dPCR)是近年来已成功实现商业化的基于单分子分析的核酸检测技术.通过对条件的优化,dPCR可以消除探针的交叉活性,不过目前商业化的dPCR一般只有2个通道,对于同时检测3个多态性需要更加细致的优化.本研究以rs6983267位点的CCAT2基因3种多态性检测为例,利用探针的交叉活性反应检测其3个多态性位点.检测涉及到3个探针:2个针对多态性位点,另1个位于多态性位点外侧作为参照探针.结果表明,成功地区分了3个包含多态性位点基因片段的簇.在本研究中交叉活性反应可以为dPCR留出白空间,利于多样品的检测.

主 题 词：数字PCR 核酸多态性 交叉活性探针 rs6983267 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 071010[071010] 1001[医学-基础医学] 07[理学] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.16476/j.pibb.2018.0190

馆 藏 号：203395136...