布尔逻辑DNA序列比对系统的软件平台设计

作     者：陈亚东 冯萍 王进科 CHEN Ya-dong;FENG Ping;WANG Jin-ke

作者机构：西北工业大学计算机学院西安710072 

出 版 物：《科学技术与工程》 (Science Technology and Engineering)

年 卷 期：2011年第11卷第7期

页      码：1468-1473,1479页

摘      要：针对目前基于动态规划的DNA序列全局比对算法时间复杂度较高,设计了一个DNA序列全局比对系统。该系统用FPGA进行序列的比对,并配备一个软件平台存储数据、发送命令以及发送和接收数据。测试数据表明,该系统的DNA序列比对时间在序列相似度较低情况下,为Needleman的42%;在序列相似度较高的情况下,为Needleman的6%。

主 题 词：FPGA DNA序列 软件平台 动态规划 

学科分类：08[工学] 0835[0835] 081202[081202] 0812[工学-测绘类] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1671-1815.2011.07.013

馆 藏 号：203395444...