潮州地区人乳头瘤病毒52型L1基因多态性分析

作     者：罗招云 陈强 杨立业 林敏 陈默蕊 

作者机构：南方医科大学附属潮州中心医院检验实验中心广东潮州521000 吉林大学公共卫生学院 

基　　金：国家自然科学基金(81101329) 广东省医学科研基金(A2011760) 

出 版 物：《中国实验诊断学》 (Chinese Journal of Laboratory Diagnosis)

年 卷 期：2013年第17卷第5期

页      码：793-798页

摘      要：目的研究潮州地区优势型别人乳头瘤病毒(HPV)52型L1基因多态性。为基于L1基因工程疫苗的设计和应用提供理论依据。方法采用核酸分子快速导流杂交分型技术(HybriMax)检出HPV52,提取101例HPV52单纯感染者宫颈脱落细胞DNA,通过4对特异性引物分别扩增HPV52-L1编码区全序列,进行测序及BLAST多态性分析。结果本研究成功获得73条HPV52L1基因全序列(1590bp)。该序列与天津参考株(GQ472848)的一致性为99%。在潮州地区发现的所有L1基因序列中有31个碱基是可发生变异的,其中25种为同义突变,6种为有义突变。根据基因多态性分东亚群和欧洲群2群。东亚群有13组,其中CZ52A105是本地最常见的变异株,占61.64%(45/73),该组称为潮州地方株,其编码序列与泰国清迈报道的IN141070株(HQ537743)完全匹配,其余各组(21/73)多态性国际上均尚未报道,他们均与天津报道的TJ49-52(GQ472848)株以及泰国报道的IN141070(HQ537743)株亲缘关系最近,有1～6个碱基不同。欧洲群有2组为CZ52E928(2/73)和CZ52E136(5/73),其基因序列分别与德国REF(X74481)株和北美洲Qv03719(HQ537745)株的L1全序列完全匹配。结论潮州地区HPV52-L1基因多态性与中国东南部和东南亚国家报道的类似,CZ52A105是潮州地方株。

主 题 词：人乳头瘤病毒 52型 L1基因 序列分析 多态性 

学科分类：1002[医学-临床医学类] 100214[100214] 10[医学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1007-4287.2013.05.001

馆 藏 号：203396516...