骨肉瘤中DNAzymes针对ezrin mRNA作用靶点筛选及体外验证

作     者：张国如 王晋 王姚斐 陈运崇 杜秀藩 ZHANG Guo-ru;WANG Jin;WANG Yao-fei;CHEN Yun-chong;DU Xiu-fan

作者机构：海南省第三人民医院骨科海南三亚572000 中山大学附属第一医院骨科广东广州510080 

基　　金：海南省自然科学基金(编号:310182) 

出 版 物：《海南医学》 (Hainan Medical Journal)

年 卷 期：2013年第24卷第20期

页      码：2965-2967页

摘      要：目的对Ezrin mRNA的4个DNAzymes靶点AU1655、AU1751、AU1766、AU1789通过体外实验进行验证,寻找最佳的作用位点。方法同时使用RNAdraw、RNAstructure和OligoWalk 3个程序对Ezrin mRNA的DNAzymes靶点进行了设计和筛选,对最终选出的4个位点AU1655、AU1751、AU1766、AU1789进行实验研究。结果 4个DNAzymes分别命名为Dz1655、Dz1751、Dz1766和Dz1789,酶切反应结果只有Dz1751在预期的位点成功切割了ezrin全长的mRNA,得到了128 bp和1 633 bp两个片段,其他3个DNAzymes均未能有效地完成切割;反应后所剩留底物RNA中位点AU1751最少,位点AU1751是DNAzymes切割ezrin mRNA的最佳位点。结论核酸二级结构联合热动力学参数可以最大程度预测和设计DNAzymes针对ezrin mRNA的作用位点。

主 题 词：Ezrin 靶点 DNAzymes 二级结构 

学科分类：1002[医学-临床医学类] 100214[100214] 10[医学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1003-6350.2013.20.1239

馆 藏 号：203396697...