抗HPV11 E2核酶的计算机设计

作     者：侯化 王曙 杨光彩 HOU Hua;WANG Shu;YANG Guang-cai

作者机构：第一军医大学生化教研室广州510515 复旦大学生命科学院遗传学研究所上海200433 

基　　金：国家自然科学基金 (项目号 3970 0 12 9) 广东省自然科学基金(项目号 970 332 )资助课题 

出 版 物：《生物技术通讯》 (Letters in Biotechnology)

年 卷 期：2001年第12卷第2期

页      码：81-84页

摘      要：借助计算机软件分析 ,设计出能特异性切割HPV11型 644ntE2mRNA的核酶。遵循Symons锤头状核酶结构和GUX剪切位点原则 ,靶序列存在 3 2个剪切位点 ,通过计算机软件分析核酶的最佳剪切位点 ,并对底物及核酶的二级结构进行预测及进行相应基因生物学功能和基因同源性分析 ,筛选出 2个锤头结构核酶。针对这两位点设计的核酶分别命名为RZ2 777和RZ3 2 81。计算机分析显示 ,两核酶与底物切点两翼碱基形成锤头状结构 ,切点所在基因序列具有相对松弛的二级结构 ,位于该基因重要生物功能区内 ,是核酶的理想攻击区域 ,通过基因库检索 ,在已知人类基因中排除了与上述两核酶切点两翼碱基有基因同源性序列的可能性。并非所有的GUX位点 (X :C、U、A)或CUX均可作为核酶的最佳剪切位点 ,计算机分析可帮助尽快选择出最适核酶 ,指导进行核酶体外转录载体构建并进行切割反应 ,为下一步将核酶用于细胞内和体内试验打下基础。

主 题 词：核酸 计算机设计 人乳头瘤病毒 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 071010[071010] 081704[081704] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 082203[082203] 0822[工学-核工程类] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1009-0002.2001.02.001

馆 藏 号：203397023...