黄花苜蓿LEA3基因片段克隆与生物信息学分析

作     者：刘亚玲 王俊杰 云锦凤 赵彦 侯永霞 Liu Yaling;Wang Junjie;Yun Jinfeng;Zhao Yah;Hou Yongxia

作者机构：内蒙古农业大学生态环境学院内蒙古自治区草品种育繁工程技术研究中心呼和浩特010019 

基　　金：国家高技术研究发展计划("863"计划)项目(2009AA10Z108) 内蒙古自然科学基金项目(2009MS0404) 内蒙古科技重大项目(20091401) 

出 版 物：《生物技术通报》 (Biotechnology Bulletin)

年 卷 期：2011年第27卷第7期

页      码：82-87页

摘      要：根据紫花苜蓿LEA3-1 mRNA(EU665182)的cDNA序列,设计1对特异引物,以经过ABA干旱胁迫处理的黄花苜蓿为材料,提取总RNA。采用RT-PCR方法克隆获得了747 bp的cDNA片段,命名为MfLEA3-1(GenBank登录号:HQ327439)。推测该序列编码了248个氨基酸,这些氨基酸主要由10.1%苏氨酸(Thr)、24.6%丙氨酸(Ala)、17.7%赖氨酸(Lys)和12.9%天冬氨酸(Asp)组成,不含有半胱氨酸和色氨酸,这与其他物种LEA蛋白成分非常接近。该氨基酸序列中存在13个11-mer重复序列,根据第3组蛋白分类标准,MfLEA3-1蛋白比较接近于type I,但是11-mer重复中残基分布与type I有所不同,推测MfLEA3-1蛋白属于新的第3组LEA蛋白类型。黄花苜蓿中成功获得了LEA3基因片段,为最终克隆黄花苜蓿LEA3基因序列全长奠定基础。

主 题 词：黄花苜蓿 LEA3基因 克隆 生物信息学 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 090503[090503] 0909[0909] 07[理学] 0905[农学-林学类] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 090102[090102] 

D　O　I：10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2011.07.006

馆 藏 号：203411033...