鲤鱼6个群体间MHCⅡB基因第3外显子的多态性分析

作     者：闵霞 贾智英 李池陶 李飞 石连玉 MIN Xia;JIA Zhi-ying;LI Chi-tao;LI Fei;SHI Lian-yu

作者机构：中国水产科学研究院黑龙江水产研究所哈尔滨150070 上海海洋大学水产与生命学院上海201306 

基　　金：现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-46-02) 黑龙江省自然科学基金(C201044) 公益性行业(农业)科研专项(200903045) 黑龙江水产研究所基本科研业务费专项资金(201005) 国家高技术研究发展计划(2011AA100402)共同资助 

出 版 物：《安徽农业大学学报》 (Journal of Anhui Agricultural University)

年 卷 期：2012年第39卷第2期

页      码：195-200页

摘      要：根据已克隆的鲤鱼MHC Ⅱ B基因序列,设计1对特异性引物,采用PCR-SSCP方法对6个鲤鱼群体MHC Ⅱ B基因第3外显子108 bp扩增片段进行多态性分析,结果共获得7种基因型（A-G）,其中基因型为B型的个体数占所有群体总个体数的47.45%,且分布于所有群体,其它6种基因型出现频率范围为1.1%~17.15%。回收不同基因型的片段并测序,经比对共发现4个碱基多态位点和3个氨基酸多态位点。易捕鲤和大头鲤两群体中各发现4个突变位点（占3.7%）;松荷鲤、松浦鲤和德国镜鲤群体各发现3个突变位点（占2.7%）;松浦镜鲤群体仅发现2个突变位点（占1.8%）。用Popgene软件计算每个群体不同位点的杂合度和多态信息含量（PIC）,6个鲤鱼群体的观测杂合度（Ho）最大值为0.746 4,最小值为0.103 7;多态信息含量为0.062 3~0.360 9。该研究将为今后深入研究鲤鱼MHC基因多态性及与鲤鱼抗病新品种的选育提供理论依据。

主 题 词：MHC 鲤鱼 多态性 多态核苷酸位点 连锁不平衡 

学科分类：090801[090801] 0908[0908] 09[农学] 

D　O　I：10.13610/j.cnki.1672-352x.2012.02.033

馆 藏 号：203411466...