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中国地鼠线粒体DNA 16S rRNA基因序列分析及分子系统发育研究

中国地鼠线粒体DNA 16S rRNA基因序列分析及分子系统发育研究

作     者:宋国华 高继萍 王裕 王春芳 刘田福 SONG Guo-hua;GAO Ji-ping;WANG Yu;WANG Chun-fang;LIU Tian-fu

作者机构:山西医科大学实验动物中心太原030001 

基  金:山西省自然科学基金(No.2012011034-1) 山西省实验动物专项资金资助(No.2009K01) 

出 版 物:《中国实验动物学报》 (Acta Laboratorium Animalis Scientia Sinica)

年 卷 期:2013年第21卷第2期

页      码:52-55页

摘      要:目的通过克隆分析中国地鼠16S基因的部分序列,对中国地鼠16S基因的结构和功能进行初步探索和揭示。方法从GenBank中已报道的啮齿动物16S基因保守区设计一对引物,进行PCR扩增,测序。用Blastn与GenBank中七种啮齿类动物的16S基因进行序列比较,分析其碱基组成及变异情况,并用邻接法(NJ)、非加权组平均法(UPGMA)构建分子系统树,在分子水平上探讨中国地鼠和其他啮齿类动物的进化关系,对中国地鼠的种属地位进行了进一步验证。结果获得了中国地鼠线粒体16S基因的部分序列,其碱基组成A、T、C、G分别为40.5%、24.5%、18.7%、16.3%,与其他七种啮齿类动物的碱基含量相比,各碱基含量基本相似。NJ进化树表明,中国地鼠、金黄地鼠与欧洲仓鼠先聚为一支,小鼠与大鼠先聚为一支,东方田鼠、台湾田鼠与东欧田鼠先聚为一支。结论中国地鼠和金黄地鼠的亲缘关系最近,与传统的分类地位基本吻合。

主 题 词:中国地鼠 线粒体DNA 16S rRNA 序列分析 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 071002[071002] 

核心收录:

D O I:10.3969/j.issn.1005-4847.2013.02.010

馆 藏 号:203411913...

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