番茄黄化曲叶病毒北京分离物的全基因组序列测定及进化分析

作     者：芦佳 刘健 王慧 肖雅文 李常保 曹鸣庆 徐杰 姚磊 

作者机构：内蒙古师范大学生命科学与技术学院呼和浩特010022 北京市农林科学院农业生物技术研究中心北京100097 北京市农林科学院蔬菜研究中心北京100097 

基　　金：北京市科技计划项目(D111100001311002) 国家自然基金项目(30860063) 

出 版 物：《内蒙古大学学报（自然科学版）》 (Journal of Inner Mongolia University：Natural Science Edition)

年 卷 期：2014年第45卷第3期

页      码：273-280页

摘      要：番茄黄化曲叶病（tomato yellow leaf curl disease，***）在我国危害日益严重．为了对该病进行深入有效的了解，根据已知的番茄黄化曲叶病毒（tomato yellow leaf curl virus，TYLCV）基因组DNAA序列的保守区段，设计两对背向引物；针对北京地区的3个TYLCV分离物进行分子鉴定．结果显示该分离物为单组分病毒，不含DNA—B和卫星DNA—G，是TYLCV的2个新分离物．TYLCV—BJ1与BJ2基因组全长分别为2781bp和2779bp，同源性为99．8％，都编码6个开放阅读框．对TYLCV的分子进化分析表明，国内现已发现的TYLCV株系亲缘关系都很接近，同源性在97．1～99．9％，属于以色列TYLCVIL株系进化下的一个近代分支．从全基因组和各基因的逐个比对结果看，TYLCV的AV1和AV2保守性最高，其次是AC2和AC3．当TYLCV—Mid进化成TYLCV-IL时，ACl和AV4基因发生了较大的变化，IR区的同源性更是从小于70％上升到94．3％．国内的TYLCV株系分成2个亚群，但在地理分布上没有形成严格的区域限定，北京分离物属于CNI亚群．

主 题 词：番茄黄化曲叶病毒 分子检测 序列分析 进化 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 1007[医学-药学类] 100705[100705] 07[理学] 09[农学] 0904[农学-动物医学类] 090401[090401] 071005[071005] 090402[090402] 10[医学] 

D　O　I：10.13484/j.nmgdxxbzk.20140308

馆 藏 号：203412349...