香蕉枯萎病菌GATA转录因子基因Fnr1的克隆及序列分析

作     者：漆艳香 张欣 张贺 陆英 蒲金基 喻群芳 谢艺贤 QI Yan-xiang;ZHANG Xin;ZHANG He;LU Ying;PU Jin-ji;YU Qun-fang;XIE Yi-xian

作者机构：中国热带农业科学院环境与植物保护研究所.农业部热带农林有害生物入侵监测与控制重点开放实验室.海南省热带农业有害生物监测与控制重点实验室海口571101 

基　　金：国际科技合作与交流专项(2012DFG31840) 现代农业产业技术体系建设专项(CARS-32-04) 

出 版 物：《果树学报》 (Journal of Fruit Science)

年 卷 期：2014年第31卷第4期

页      码：689-696页

摘      要：【目的】明确香蕉枯萎病菌(Fusarium oxysporum ***)2个生理小种(Foc1和Foc4)GATA转录因子基因(Fnr1)的序列差异,为进一步研究Fnr1在香蕉枯萎病菌致病过程中的作用奠定基础。【方法】根据番茄枯萎病菌2号生理小种(*** *** race 2)和水稻恶苗病菌(Gibberella fujikuroi)的GATA转录因子的氨基酸序列设计引物,利用重叠延伸PCR和RT-PCR技术分别克隆了香蕉枯萎病菌2个生理小种的Fnr1的全长DAN,并对该基因所编码蛋白进行了氨基酸序列特征、系统发育与保守结构域分析。【结果】2个生理小种的Fnr1(分别命名为F1nr1和F4nr1)DNA片段全长分别为2 967 bp和2 958 bp,开放阅读框架分别为2 727 bp和2 718 bp,分别编码908个和905个氨基酸。F1nr1和F4nr1的预测氨基酸序列相似性为99%,与GenBank中公布的Fusarium ***转录因子氨基酸序列均有88%~99%相似性。氨基酸序列聚类分析显示,F1nr1和F4nr1与GenBank中已登陆的香蕉枯萎病菌1号生理小种(*** *** race 1,Foc1)、尖孢镰刀菌(***)和番茄尖孢镰刀菌2号生理小种(*** *** race 2)等物种的GATA转录因子蛋白高度同源。蛋白质保守域搜索表明,F1nr1和F4nr1具有GATA结合蛋白的功能域,属于GATA结合蛋白家族的一员。【结论】香蕉枯萎病菌Fnr1基因具备GATA构型转录因子家族的序列特征,推测该基因可能参与调控*** ***氮调控相关基因的表达及致病性等。

主 题 词：香蕉枯萎病 尖孢镰刀菌古巴专化型 GATA转录因子 Fnr1 克隆 序列分析 

学科分类：09[农学] 0904[农学-动物医学类] 090401[090401] 090402[090402] 

D　O　I：10.13925/j.cnki.gsxb.20130492

馆 藏 号：203413500...