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番茄黄化曲叶病毒石家庄分离物的分子鉴定及序列分析

番茄黄化曲叶病毒石家庄分离物的分子鉴定及序列分析

作     者:白晓娟 李亚栋 王国华 尹庆珍 耿保进 董文琦 周春江 吴志明 

作者机构:河北省农林科学院经济作物研究所石家庄050051 河北师范大学生命科学学院石家庄050024 

基  金:河北省财政专项计划项目(2013055003) 河北省农林科学院院士合作项目(A2012050601) 河北省科技支撑计划项目(14226310D) 

出 版 物:《园艺学报》 (Acta Horticulturae Sinica)

年 卷 期:2015年第42卷第1期

页      码:167-173页

摘      要:根据番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)基因组序列的复制酶保守区设计1对引物JC1,对石家庄具有典型番茄黄化曲叶病毒症状的番茄样品进行检测,经PCR扩增得到626 bp的片段,序列分析比对表明其为TYLCV的一部分。根据上述序列设计1对特异引物QC,通过PCR分离石家庄的TYLCV全长序列并进行测序。同时利用已报道的DNA-B的通用引物CR01/CR02进行PCR扩增。结果表明石家庄分离物只含有DNA-A组分,全长为2 781 bp(Gen Bank登录号:KF612971),命名为TYLCV-Shijiazhuang。基因组序列比较发现,该分离物与TYLCV-Israel株系相似性为99.0%。基因组序列系统进化分析表明,石家庄病毒分离物与北京分离物TYLCV-Beijing3(Gen Bank登录号:GU983859)、山东分离物TYLCV-SDSG-XC(Gen Bank登录号:KC999851)序列相似性很高,均属于TYLCV-Israel分支。

主 题 词:番茄 番茄黄化曲叶病毒(TYLCV) DNA-A 分子鉴定 序列分析 

学科分类:09[农学] 0904[农学-动物医学类] 090401[090401] 090402[090402] 

核心收录:

D O I:10.16420/j.issn.0513-353x.2014-0557

馆 藏 号:203419738...

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