16srDNA序列分析在腹泻粪便标本菌群分析应用

作     者：李振军 戎建荣 张守印 金东 叶长芸 孙强正 张集 赵爱兰 徐建国 LI Zhen-jun;RONG Jian-rong;ZHANG Shou-yin;JIN Dong;YE Chang-yun;SUN Qiang-zheng;ZHANG Ji;ZHAO Ai-lan;XU Jian-guo

作者机构：中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206 

出 版 物：《中国人兽共患病学报》 (Chinese Journal of Zoonoses)

年 卷 期：2008年第24卷第2期

页      码：100-103页

摘      要：目的应用16s rDNA序列分析方法,对临床实验室没有分离到已知病原菌的腹泻病人粪便标本进行菌群分析,为腹泻病人的病原学诊断提供线索。方法根据细菌16s rDNA保守区序列设计通用引物,以腹泻病人粪便标本中的总DNA为模板,PCR扩增16s rDNA片段。将获得的片段克隆入T载体进行测序,与数据库中发表序列的进行比对,判断标本中细菌的种类和比例;PCR扩增常见的五类致病性大肠杆菌的特征基因应用于排除诊断。结果在3份粪便标本中,大肠杆菌为优势菌群(所占比例分别为84%、65%和81%);其他种群细菌为拟杆菌属(Bacteroides)、柠檬酸杆菌属(Citrobacter)和普雷沃氏菌属(Prevotella)等;实验室常规培养方法没有分离到常见的五类致病性大肠杆菌;PCR扩增没有发现常见的五类致病性大肠杆菌的特征基因。结论引起三例病人腹泻的病原菌可能是一种新的大肠杆菌;16s rDNA序列分析方法可应用于腹泻粪便标本菌群分析,为常规的病原培养方法提供补充,对疾病的诊断提供线索。

主 题 词：16s rDNA序列 粪便标本 菌群分析 

学科分类：1007[医学-药学类] 100705[100705] 1004[医学-公共卫生预防医学类] 1001[医学-基础医学] 100103[100103] 100401[100401] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.3969/j.issn.1002-2694.2008.02.002

馆 藏 号：203420038...