共显性分子标记基因型数据转换为二元型数据的处理软件及其在研究种质资源遗传多样性中的意义

作     者：夏寒冰 卢宝荣 XIA Han-bing;LU Bao-rong

作者机构：复旦大学生物多样性研究所/生物多样性与生态工程教育部重点实验室上海200433 

基　　金：国家重点基础研究发展规划(973)项目(2006CB100205) 上海市科委基础重点项目(08JC1401700) 

出 版 物：《植物遗传资源学报》 (Journal of Plant Genetic Resources)

年 卷 期：2009年第10卷第1期

页      码：97-102页

摘      要：遗传多样性研究是植物种质资源有效利用和保护的重要基础。遗传多样性研究所采用的分子标记工具主要有显性和共显性两种,两种不同类型的分子标记将产生不同的数据类型。显性分子标记产生二元型数据,共显性分子标记产生基因型数据。数据形式不同给遗传多样性的分析和研究带来多方面的困难,不同类型数据之间的互相比较也需要将基因型数据进行二元型转换。本研究基于Excel平台,设计开发了将基因型数据转换成二元型数据的处理软件。该软件按照基因型数据向二元型数据转换的原理,可以将庞大的分子标记基因型数据矩阵,迅速、高效、准确地转换成二元型(0、1)数据矩阵。利用显性分子标记ISSR和共显性分子标记SSR对野生大豆居群遗传多样性的案例分析表明,将共显性分子标记的基因型数据转换为二元型数据,有利于种质资源遗传多样性研究中不同分子标记获取的遗传多样性结果之间的比较和综合分析。

主 题 词：基因型数据 二元型数据 数据转换软件 遗传多样性分析 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 090102[090102] 

核心收录：

D　O　I：10.13430/j.cnki.jpgr.2009.01.002

馆 藏 号：203425511...