利用ARIMA模型对木聚糖酶F/10和G/11的进化过程分析

作     者：王伟 朱平 WANG Wei;ZHU Ping

作者机构：江南大学理学院江苏无锡214122 

基　　金：江南大学创新团队发展计划(PIRTJiangnan)资助 

出 版 物：《生物技术》 (Biotechnology)

年 卷 期：2011年第21卷第1期

页      码：37-40页

摘      要：目的:利用ARIMA模型对木聚糖酶(Xylanase)F/10和G/11家族的进化过程进行分析,并分析两家族中同时含量较高的氨基酸在进化中的特征。方法:计算出每条序列中均含量较高的几种氨基酸,利用SAS时间序列中的ARIMA模型,选取木聚糖酶F/10和G/11两个家族的各十条进化阶段不同的序列,设计一个时间序列实验进行分析。结果:F/10家族的进化是平稳的,甘氨酸含量逐渐降至7%左右,缬氨酸的含量稳定的保持在7%上下,而G/11家族的进化存在较大波动,甘氨酸含量升至14%左右,丙氨酸含量相对于F/10家族稳定。结论:F/10家族的进化比G/11家族稳定,甘氨酸在两家族进化存在明显差异,这对研究木聚糖酶分子的进化以及同义密码子的偏好性具有一定的指导意义。

主 题 词：木聚糖酶 ARIMA模型 同义密码子 

学科分类：07[理学] 08[工学] 070104[070104] 0701[理学-数学类] 081202[081202] 0812[工学-测绘类] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1004-311X.2011.01.013

馆 藏 号：203426280...