Marc-145细胞源DDX6基因的克隆及生物信息学分析

作     者：张升波 李昌红 温贵兰 徐丽 田浪 杨佰启 陈彦希 文明 王开功 程振涛 Shengbo Zhang;Changhong Li;Guilan Wen;Li Xu;Lang Tian;Baiqi Yang;Yanxi Chen;Ming Wen;Kaigong Wang;Zhentao Cheng

作者机构：贵州大学动物科学学院贵州贵阳550025 贵州省动物疫病研究室贵州贵阳550025 

基　　金：国家自然科学基金项目(“P-body在PRRSV复制和持续感染过程中的作用机制研究”,No.31460668) 贵州省科学技术基金项目(“NSP2亚类在PRRSV复制过程中的作用机制研究”,No.黔科合J字2046) 贵州大学博士基金项目(“LSm14A分子在新城疫病毒增殖中的作用”,No.12) 贵州省科技平台及人才团队计划(5253) 千层次创新型人才-2015年度贵州省高层次创新型人才培养(No.黔财教号Z174016) 

出 版 物：《生物技术》 (Biotechnology)

年 卷 期：2018年第28卷第6期

页      码：566-571,596页

摘      要：[目的]克隆并生物信息学分析Marc-145细胞源DDX6基因。[方法]根据GenBank预测的猴源DDX6基因序列(XM_008021118)设计合成特异性引物,通过RT-PCR从Marc-145细胞中扩增DDX6基因CDS区并进行克隆和生物信息学分析。[结果]Marc-145细胞源DDX6基因CDS全长1452bp,编码483个氨基酸。DDX6蛋白有4个基序,含有DEAD-like解旋酶超家族结构域和C端结构域。二级结构主要以α-螺旋(37.27%)和无规则卷曲(36.44%)为主。同源性及系统进化树分析结果表明Marc-145细胞源与人DDX6核苷酸同源性最高,亲缘关系最近。[结论]DDX6分子在同种属之间具有高度保守性,提示Marc-145细胞源DDX6可能与人源DDX6分子具有相似的功能和作用。

主 题 词：DDX6基因 克隆 生物信息学分析 

学科分类：090603[090603] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D　O　I：10.16519/J.CNKI.1004-311X.2018.06.0098

馆 藏 号：203429559...