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鸭Toll样受体3基因克隆及序列分析

鸭Toll样受体3基因克隆及序列分析

作     者:宋凯杰 李传峰 陈宗艳 孟春春 黄云秀 李丹丹 刘光清 张淼涛 

作者机构:西北农林科技大学动物医学院陕西杨凌712100 中国农业科学院上海兽医研究所上海200241 广西大学动物科技学院广西南宁530004 

基  金:公益性农业科研专项项目(201003012) 上海市科委创新计划项目(13391901602) 

出 版 物:《动物医学进展》 (Progress In Veterinary Medicine)

年 卷 期:2015年第36卷第7期

页      码:22-28页

摘      要:为研究鸭Toll样受体3(TLR3)的结构及功能,根据GenBank中已公布的番鸭TLR3(JQ910167.1)基因设计引物,采用RT-PCR从北京鸭外周血单个核细胞中克隆出北京鸭TLR3,命名为duTLR3。利用生物信息学技术预测其结构及功能,研究表明,duTLR3基因开放阅读框为2 688bp,编码895个氨基酸,富含17.0%亮氨酸;该分子属于Ⅰ型跨膜受体,由胞外区(1-695aa)、跨膜区(696-718aa)和胞内区(719-895aa)3部分组成,N端含有一个信号肽序列,胞外富含18个亮氨酸重复序列(LRR),胞内含有Toll/IL-1R同源区结构域。核苷酸序列同源性分析显示,duTLR3与金定鸭TLR3亲缘关系最接近达到99.6%;与番鸭、鹅、原鸡、斑胸草雀的亲缘关系次之,并同属于禽类分支上;与番鸭、鹅、原鸡、斑胸草雀、人、猕猴、狒狒、小鼠、大鼠、猪、牛、羊、猫亲缘关系渐远;与草鱼和鲤鱼亲缘关系最远。北京鸭体内组织分布结果显示,duTLR3为组成性表达。本研究成功克隆了北京鸭TLR3基因,预测分析并证实了duTLR3具有典型的TLR家族结构特征,为后期探究TLR3如何识别病毒的RNA及引起下游信号级联反应奠定了基础。

主 题 词:北京鸭 TLR3 分子克隆 序列分析 结构预测 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 071009[071009] 09[农学] 0901[农学-植物生产类] 090102[090102] 

D O I:10.16437/j.cnki.1007-5038.2015.07.007

馆 藏 号:203432833...

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