山羊溶酶体α-AMA基因的克隆、生物信息学及组织表达谱分析

作     者：孔祥雅 李义 程敏 荆新堂 李勤凡 KONG Xiang-ya;LI Yi;CHENG Min;JING Xin-tang;LI Qin-fan

作者机构：西北农林科技大学动物医学院杨凌712100 

基　　金：国家自然科学基金项目(30871902) 陕西省科技攻关项目(2008k02-06-2) 

出 版 物：《畜牧兽医学报》 (ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA)

年 卷 期：2012年第43卷第5期

页      码：826-831页

摘      要：本研究旨在对山羊溶酶体α-甘露糖苷酶(α-AMA)基因进行组织表达谱和生物信息学分析。参考牛α-AMA基因序列设计引物,采用PCR技术克隆山羊α-AMA基因序列,并利用荧光定量RT-PCR进行组织表达谱分析以及进行生物信息学预测。首次获得了山羊α-AMA基因,含有完整CDS编码区3 000bp,编码999个氨基酸,其中前50个氨基酸为信号肽序列。其编码区的核苷酸序列和预测氨基酸序列与牛的α-AMA相似性最高,分别为95.93%和94.79%。组织表达谱分析表明α-AMA在山羊各组织均不同程度的表达,其中在肺脏、肝脏、小脑表达量较高。生物信息学预测发现,α-AMA蛋白属于糖苷水解酶38家族成员,有2个保守的结构域,存在9个N-糖基化位点。SWISS-MODEL同源建模山羊α-AMA具有良好的可信度。本研究为探讨酶的作用机理及疯草解毒剂的研制提供了理论依据。

主 题 词：α-甘露糖苷酶 基因克隆 荧光定量PCR 生物信息学 同源建模 

学科分类：090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

核心收录：

馆 藏 号：203434837...