中蜂囊状幼虫病毒LN-QY株VP3蛋白空间结构及其B细胞抗原表位的预测

作     者：费东亮 毛靖宇 宋英今 马鸣潇 FEI Dong-liang;MAO Jing-yu;SONG Ying-jin;MA Ming-xiao

作者机构：辽宁医学院畜牧兽医学院辽宁锦州121001 赤峰市翁牛特旗医院检验科内蒙古赤峰024500 天津大学农业与生物工程学院天津300072 

基　　金：国家自然科学基金(30972200) 辽宁省高等学校优秀人才支持计划 

出 版 物：《中国生物制品学杂志》 (Chinese Journal of Biologicals)

年 卷 期：2012年第25卷第9期

页      码：1106-1111页

摘      要：目的预测中蜂囊状幼虫病毒(Chinese sacbrood virus,CSBV)LN-QY株VP3蛋白的空间结构及其B细胞抗原表位。方法采用RT-PCR法从感染CSBV的蜜蜂幼虫总RNA中扩增结构蛋白VP3基因,与pMD18-T载体连接后,转化感受态大肠杆菌DH5α,提取质粒,双酶切鉴定并测序,通过与SBV-KOR、CSBV-UK株VP3基因序列的比对,获得LN-QY株VP3基因的核苷酸序列及推导的氨基酸序列,建立VP3蛋白的3D结构。在此基础上,应用DNAStar软件中的Protean模块综合分析结构蛋白的柔性区域、亲水性、表面可能性以及抗原指数等参数。结果 VP3结构蛋白的空间构象较规则,其可能的B细胞抗原表位区域位于4个区域:25-50,101-109,112-120,250-268氨基酸区段,其中,可能出现抗原表位的2个区域在100-150和250-300氨基酸区段,应作为抗原表位研究的重点区域。结论预测了CSBV LN-QY株VP3蛋白的空间结构及其B细胞抗原表位,为CSBVVP3蛋白单克隆抗体的制备以及表位疫苗的设计奠定了理论基础。

主 题 词：中蜂囊状幼虫病毒 VP3结构蛋白 空间结构 B细胞抗原表位 预测 

学科分类：07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 090102[090102] 0710[理学-生物科学类] 0831[工学-公安技术类] 1002[医学-临床医学类] 1001[医学-基础医学] 0906[农学-水产类] 0703[理学-化学类] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 

核心收录：

D　O　I：10.13200/j.cjb.2012.09.27.feidl.018

馆 藏 号：203442504...