甜瓜STK类R基因同源序列的克隆与分析

作     者：张志忠 孙志浩 蓝茂锋 ZHANG Zhi-zhong;SUN Zhi-hao;LAN Mao-feng

作者机构：福建农林大学园艺学院福建福州350002 

基　　金：国家"十一五"科技支撑计划项目子课题(2007BAD07B03) 福建省重大专项项目(2008NZ0002-1) 福建省自然科学基金资助项目(2011J01083) 

出 版 物：《植物资源与环境学报》 (Journal of Plant Resources and Environment)

年 卷 期：2012年第21卷第3期

页      码：8-12页

摘      要：以植物丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶类(serine-threonine kinase,STK)抗病基因产物催化结构域Ⅰ和Ⅸ的保守氨基酸序列(FGK/V/L/SVYK/RG,DY/IYSF/YGV/I/M)设计简并引物,对甜瓜(Cucumis melo L.)基因组DNA进行PCR扩增,得到大约500 bp的目的条带,通过重组质粒克隆并经PCR检测后得到12条不同的DNA序列,命名为tg1～tg12,其中tg2、tg5、tg9和tg12(Genbank登录号为JN646853～JN646856)可以编码完整的氨基酸序列。Blast分析结果显示:4条序列均具有ATP结合部位、底物结合部位和激酶结构域的活化环(A-loop)等,属于典型的蛋白激酶基因家族,可能是STK类R基因的同源序列片段;4条序列与蓖麻(Ricinus communis L.)的STK同源性均较高。氨基酸序列比对结果显示tg2、tg5、tg9和tg12均具有R基因的9个保守结构域,为STK类候选抗病基因类序列。分子系统树显示tg2、tg5、tg9和tg12与已知的R基因(Pto、Lr10和Lectin)在氨基酸水平上的相似性仅为33.5%～53.4%,且4个甜瓜同源序列的氨基酸相似性也较低,表明甜瓜RGAs标记可能具有较高的特异性。

主 题 词：甜瓜 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 抗病基因同源序列 氨基酸序列 克隆 同源性 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090201[090201] 090102[090102] 

核心收录：

D　O　I：10.3969/j.issn.1674-7895.2012.03.002

馆 藏 号：203450873...