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云南草果SSR-PCR反应体系的优化及引物的筛选

云南草果SSR-PCR反应体系的优化及引物的筛选

作     者:胡一凡 狄义宁 张雪梅 杨志清 Hu Yifan;Di Yining;Zhang Xuemei;Yang Zhiqing

作者机构:云南农业大学农学与生物技术学院昆明650201 云南农业大学云南省药用植物生物学重点实验室昆明650201 云南农业大学西南中药材种质创新与利用国家地方联合工程研究中心昆明650201 云南省芳香生物工程技术研究中心昆明650201 

基  金:国家自然科学基金项目(81560615) 云南省社会发展科技计划项目(2011CG015) 云南省科技惠民计划项目(2015RA083) 云南省科技计划项目(2018DH010)共同资助 

出 版 物:《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期:2019年第17卷第1期

页      码:195-200页

摘      要:草果为药食两用的草本植物,近年来在市场上供不应求,但关于草果居群的分子鉴定及种质资源的研究极为稀少。为使云南草果产业更加健康和可持续的发展,本实验对云南草果进行了SSR-PCR反应体系的优化及引物的筛选,为研究草果遗传多样性提供了依据。实验采用L16(43)正交试验设计,对PCR反应体系中的3个因素(2×Taq PCR Starmix,引物, DNA模板)进行优化,并利用单因素分析法,对PCR退火温度、PCR扩增产物点样量进行实验与分析。最终确定5个因素的最佳水平,即DNA模板(50 ng/μL) 2μL,2×Taq PCR StartMix 6μL,正反引物(10μmol/L)各1.5μL,dd H2O补足至20μL (即加入ddH2O 9μL),PCR产物点样量可以选择在1.5~2μL之间。从48对SSR引物中筛选出了7对扩增结果好的引物。7个SSR引物可用于草果资源的遗传多样性研究,为分子技术研究提供了科学依据。

主 题 词:草果 反应体系优化 SSR引物筛选 

学科分类:1008[医学-中药学类] 10[医学] 

D O I:10.13271/J.MPB.017.000195

馆 藏 号:203454008...

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