口腔菌属特异性16S rRNA基因序列V1区的特征分析

作     者：赵俊丽 周围 李娜 杨帆 张红琳 周东蕊 ZHAO Jun-li;ZHOU Wei;LI Na;YANG Fan;ZHANG Hong-lin

作者机构：南京晓庄学院食品科学学院江苏南京211171 常州市第一人民医院检验科江苏常州213002 东南大学生物科学与医学工程学院江苏南京210096 

基　　金：国家自然基金(6507030) 南京市环境科学与工程重点学科建设项目资助 

出 版 物：《南京晓庄学院学报》 (Journal of Nanjing Xiaozhuang University)

年 卷 期：2018年第34卷第6期

页      码：76-81页

摘      要：为了确定针对属特异性16S rRNA基因序列V1区设计的引物位点的特异性.基于人类口腔微生物菌群16S rRNA的基因库,对其进行属水平上序列的特征分析,得出其序列突变图谱,找出V1区引物设计位点,计算该引物位点在其分属中的覆盖率并与其通用引物在各分属中的覆盖率进行比较.结果表明,17个菌属中有13个菌属的V1区引物位点在菌属中的覆盖率接近或超过90%,而4个通用引物在菌属中呈现低的覆盖率.由此得出结论,针对属特异性设计的引物位点比通用引物在各菌属中有着更好的覆盖率.该技术对于口腔和食品、肠道、环境等微生物菌群的菌种鉴定和评估方面有着重要的意义.

主 题 词：16Sr RNA gene 属特异性引物 V1区 

学科分类：1003[医学-口腔医学类] 100302[100302] 10[医学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1009-7902.2018.06.015

馆 藏 号：203454819...