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ShineRoar探针技术检测单核苷酸多态性

ShineRoar探针技术检测单核苷酸多态性

作     者:罗光华 郑璐 张晓膺 许国锋 朱江 牟琴峰 魏江 陈陆俊 张俊 徐宁 LUO Guang-hua;ZHENG Lu;ZHANG Xiao-ying;XU Guo-feng;ZHU Jiang;MU Qin-feng;WEI Jiang;CHEN Lu-jun;ZHANG Jun;XU Ning

作者机构:苏州大学附属第三医院综合实验室常州213003 苏州大学附属第三医院胸外科常州213003 苏州大学附属第三医院心内科常州213003 

基  金:国家自然科学基金(30570752) 常州市831工程资助项目(200602) 常州市卫生局资助项目(047182) 

出 版 物:《中华检验医学杂志》 (Chinese Journal of Laboratory Medicine)

年 卷 期:2007年第30卷第6期

页      码:609-612页

摘      要:目的建立一种低成本、高效率、操作简便的单核苷酸多态性(SNP)检测技术。方法采用自行设计的"ShineRoar 探针",结合融解曲线技术检测目的基因 SNP。并根据其工作原理分别对肿瘤坏死因子受体Ⅱ(TNFRⅡ)和载脂蛋白 M(apoM)的基因多态性进行检测;同时用 DNA 测序技术鉴定 ShineRoar 探针技术的准确性。结果融解曲线分析结果显示,某一基因的野生型及突变型纯合子分别在2个不同的融解温度出现融解谷。TNFRⅡ基因第6外显子196位突变(ATG→AGG)所产生的 T 和 G 等位基因的融解温度分别为(52.84±0.75)℃和(58.38±0.61)℃;apoM T-778C 突变所产生的 T 和 C 等位基因的融解温度分别为(42.55±0.73)℃和(49.19±0.57)℃。一致性 Kappa 检验显示 ShineRoar 探针技术与 DNA 测序技术的 SNP 检测结果一致(Kappa=1,P=0.000)。结论ShineRoar 探针技术简单、快速、准确,适用于大批量基因分型的研究。

主 题 词:多态性,单核苷酸 基因型 受体,肿瘤坏死因子,Ⅱ型 载脂蛋白类 

学科分类:1002[医学-临床医学类] 1010[医学-医学技术类] 100215[100215] 10[医学] 

核心收录:

D O I:10.3760/j.issn:1009-9158.2007.06.003

馆 藏 号:203455553...

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