日本蛇根草糖基转移酶基因Oj GT1的克隆与生物信息学分析

作     者：孙威 林建 申欢 马玲 鞠志刚 乙引 Sun Wei;Lin Jian;Shen Huan;Ma Ling;Ju Zhigang;Yi Yin

作者机构：贵州师范大学生命科学学院植物生理与发育调控重点实验室贵阳550025 贵阳中医学院药学院贵阳550025 西南喀斯特山地生物多样性保护重点实验室贵阳550025 

基　　金：国家自然科学基金(31760076) 贵州省教育厅青年科技人才成长项目(黔教合KY字122) 贵州省重点实验室建设项目(黔科合计Z字4005) 贵州省联合基金项目(黔科合LH字7211号 7358号) 贵州省中医药管理局中医药 民族医药科学技术研究课题(Q2YY-2016-064)共同资助 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2019年第17卷第2期

页      码：452-457页

摘      要：糖基转移酶(GTs)是花色苷合成过程中最重要的修饰酶之一,其在花色苷合成过程中发挥重要作用。本研究以日本蛇根草为材料,依据其转录组测序结果,设计引物通过RT-PCR方法成功克隆得到OjGT1基因完整的cDNA序列,随后对OjGT1的功能结构域、生理和化学参数、亲/疏水性、信号肽,二级结构等进行生物信息学分析。分析结果显示,OjGT1基因完整的CDS长度为1 413 bp,翻译形成蛋白的分子量为52.087 kD,等电点为5.12,编码形成亲水性蛋白质,不含信号肽。同时二级结构与三级结构分析显示,OjGT1蛋白结构主要以不规则卷曲为主,其次是α螺旋,延伸链所占比重最小。OjGT1基因的成功克隆与生物信息学分析,将为后续研究茜草目其它植物糖基转移酶提供参考,同时也为日本蛇根草花色苷的生物合成研究提供科学依据。

主 题 词：日本蛇根草 OjGT1 基因克隆 生物信息学分析 

学科分类：1008[医学-中药学类] 10[医学] 

D　O　I：10.13271/J.MPB.017.000452

馆 藏 号：203458877...