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大豆含硫氨基酸相关酶基因发掘

大豆含硫氨基酸相关酶基因发掘

作     者:邱红梅 郝文媛 高淑芹 马晓萍 郑宇宏 孟凡凡 范旭红 王洋 王跃强 王曙明 

作者机构:大豆国家工程研究中心、吉林省农业科学院大豆研究所长春130033 

基  金:国家高技术研究发展计划(863计划)项目(编号:2012AA101106) 现代农业产业技术体系项目(编号:CARS-04-PS11) 吉林省创新工程项目(编号:C32120402) 吉林省自然科学基金项目(编号:20140101142JC) 东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室开放基金项目(编号:SB12A02)资助 

出 版 物:《遗传》 (Hereditas(Beijing))

年 卷 期:2014年第36卷第9期

页      码:934-942页

摘      要:大豆(Glycine max)含硫氨基酸合成途径中的酶基因是含硫氨基酸组分的重要调控基因,发掘相关酶基因对高含硫氨基酸分子育种具有重要意义.文章采用大豆物理与遗传整合图谱,通过BioMercator2.1将113个含硫氨基酸合成途径酶基因及33个控制含硫氨基酸含量的QTL整合到遗传图谱Consensus Map 4.0上,依据酶基因位点与QTL的一致性以及QTL的效应值,初步筛选到16个与含硫氨基酸合成相关的候选基因.通过生物信息学方法对候选基因进行拷贝数、SNP、表达谱等分析,鉴定到12个相关酶基因,分别位于D1a、M、A2、K和G等8个连锁群上.生物信息学分析显示这些基因所在QTL可解释含硫氨基酸遗传变异的6.0%~38.5%,其中9个基因的间接效应值超过10%. 12个相关酶基因参与含硫氨基酸代谢的重要途径,且多在子叶、花中高丰度表达,存在丰富的SNP.这些基因可作为候选基因进行功能标记开发,将为大豆分子设计育种奠定基础.

主 题 词:大豆 含硫氨基酸 合成途径 酶基因 生物信息学 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 090102[090102] 

核心收录:

D O I:10.3724/SP.J.1005.2014.0934

馆 藏 号:203458880...

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