木糖还原酶定点突变设计的生物信息学分析

作     者：杜红丽 王靖方 曾琦锴 凌飞 魏冬青 林影 王小宁 Du Hong-li;Wang Jing-fang;Zeng Qi-kai;Ling Fei;Wei Dong-qing;Lin Ying;Wang Xiao-ning

作者机构：华南理工大学生物科学与工程学院广东广州510006 上海交通大学生命科学与工程学院上海200240 

基　　金：广东省自然科学基金资助项目(063001990) 

出 版 物：《华南理工大学学报（自然科学版）》 (Journal of South China University of Technology(Natural Science Edition))

年 卷 期：2008年第36卷第12期

页      码：122-127页

摘      要：木糖代谢过程中,木糖还原酶(XR)和木糖醇脱氢酶(XDH)的氧化还原不平衡是利用纤维素生成酒精的关键问题之一.文中借助生物信息学手段(同源建模、酶和辅酶分子对接),通过分析数据库资源,找到了一些影响XR活性或辅酶依赖性的关键氨基酸.结果表明:树干毕赤氏酵母XR与烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADP)之间形成氢键的氨基酸有Lys21、Val222、Glu223、Phe236和Thr273,与烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)之间形成氢键的氨基酸有Val222、Glu223、Phe236、Glu237和Thr273;突变Lys21(完全保守)使树干毕赤氏酵母XR只与辅酶NAD结合,突变Glu237(不完全保守)使树干毕赤氏酵母XR只与辅酶NADP结合;热带假丝酵母XR与NADP之间形成氢键的氨基酸有Asn278和Arg282(两者都不完全保守),要改变其NADP依赖性,可以替代Asn278和/或Arg282.

主 题 词：木糖还原酶 定点突变 同源建模 分子对接 辅酶 生物信息学 

学科分类：0831[工学-公安技术类] 0710[理学-生物科学类] 0711[理学-心理学类] 07[理学] 08[工学] 071007[071007] 

核心收录：

D　O　I：10.3321/j.issn:1000-565X.2008.12.024

馆 藏 号：203471496...