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生物信息学研究新基因LRP15

生物信息学研究新基因LRP15

作     者:徐周敏 于力 卢学春 韩为东 李续建 靖域 王书红 靳海杰 楼方定 XU Zhou-min,YU Li,LU Xue-chun,HAN Wei-dong,LI Xu-jian,JING Yu,WANG Shu-hong,JIN Hai-jie,LOU Fang-ding(Department of Hematology,PLA General Hospital,Beijing100853,China)

作者机构:中国人民解放军总医院血液实验室北京100853 

出 版 物:《生物技术通讯》 (Letters in Biotechnology)

年 卷 期:2002年第13卷第3期

页      码:187-190页

摘      要:为了利用生物信息学探索网上克隆基因与预测基因功能的新方法,首先用一段1.8kbDNA片段在人类EST数据库中进行电子杂交并对相互重叠的EST片段组装,通过引物设计进行cDNA末端快速扩增。以高通量基因组序列(HTGS)数据库及SAGE文库为基础,进行染色体定位及组织表达分析。通过DAS及RPS-BLAST程序预测其蛋白质结构及功能。结果显示,LRP15cDNA全长1718bp,含一个780bp的开放读码框架,编码259个氨基酸。该基因定位于染色体3p24,在多种组织中表达。其编码蛋白含有N端富含亮氨酸重复序列及潜在的穿膜序列。研究表明,生物信息学是克隆与预测基因功能的有效方法;LRP15基因可能是一个参与细胞发育调控的新基因。

主 题 词:生物信息学 新基因 LRP15 基因克隆 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 0831[工学-公安技术类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D O I:10.3969/j.issn.1009-0002.2002.03.009

馆 藏 号:203474169...

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