马铃薯Y病毒pipo基因的分子变异及结构特征分析

作     者：高芳銮 沈建国 史凤阳 常飞 谢联辉 詹家绥 GAO Fang-Luan;SHEN Jian-Guo;SHI Feng-Yang;CHANG Fei;XIE Lian-Hui;ZHAN Jia-Sui

作者机构：福建农林大学植物病毒研究所福建省植物病毒学重点实验室福州350002 福建出入境检验检疫局检验检疫技术中心福州350001 

基　　金：国家现代农业马铃薯产业技术体系(编号:CARS-10) 福建省自然科学基金项目(编号:2013J01088) 福建省教育厅科技项目(编号:JA12119) 福建出入境检验检疫局科技项目(编号:FK2011-07)资助 

出 版 物：《遗传》 (Hereditas（Beijing))

年 卷 期：2013年第35卷第9期

页      码：1125-1134页

摘      要：为揭示马铃薯Y病毒（Potato virus Y,PVY）pipo基因的分子变异和结构特征,文章根据文献报道的马铃薯Y病毒属（Potyvirus）pipo基因保守区序列设计一对简并引物,从感染PVY的马铃薯病叶中克隆获得pipo基因的cDNA全长序列,分析其核苷酸序列和氨基酸序列的特征,并基于氨基酸序列使用贝叶斯法重建了Potyvirus的系统发育树。结果显示：20个PVY分离物成功扩增出预期大小（约235bp）的特异性片段,其核苷酸序列与已报道的其它PVY株系的pipo基因核苷酸序列一致性均在92%以上;5′端均含有典型的G1-2A6-7基序（motif）,无碱基插入/缺失,所有的核苷酸变异都是碱基置换,共发现13个多态性位点,其中4个简约信息位点,9个单一变异位点,表明该基因高度保守,但不同分离物也存在一定的分子变异;PIPO蛋白理论等电点11.26~11.62,无信号肽和跨膜区,是可溶的亲水性蛋白;整个蛋白含有3个保守区,其中位于10~59aa的基序最为保守。该蛋白主要定位于线粒体中,可能是线粒体导肽。系统发育分析结果显示,源于PVY不同株系优先相聚成簇,而向日葵褪绿斑驳病毒（Sunflower chlorotic mottle virus,SuCMoV）与辣椒重花叶病毒（Pepper severe mosaic virus,PepSMV）的亲缘关系较PVY相比更近,与前人的结果相一致,表明PIPO蛋白可以作为研究Potyvirus系统发育关系的新的分子标记。

主 题 词：马铃薯Y病毒 pipo基因 病毒进化 

学科分类：1002[医学-临床医学类] 09[农学] 0904[农学-动物医学类] 090401[090401] 090402[090402] 

核心收录：

D　O　I：10.3724/sp.j.1005.2013.01125

馆 藏 号：203481083...