我国HIV-1 B＇亚型流行株vif基因序列特征及变异分析

作     者：李林 刘永健 鲍作义 李韩平 庄道民 刘思扬 李敬云 LI Lin;LIU Yong-jian;BAO Zuo-yi;LI Han-ping;ZHUANG Dao-min;LIU Si-yang;LI Jing-yun

作者机构：军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室北京100071 

基　　金：国家自然科学基金资助课题(30471496) 国家十五科技攻关课题资助项目(2004BA719A01) 

出 版 物：《中华微生物学和免疫学杂志》 (Chinese Journal of Microbiology and Immunology)

年 卷 期：2006年第26卷第8期

页      码：743-746页

摘      要：目的研究人免疫缺陷病毒-1(HIV-1)B 亚型vif基因的变异特征,探讨其与HIV传播和致病性之间的关系。方法采集河南省部分HIV感染者的外周血,提取41例HIV感染者外周血淋巴细胞DNA,设计特异性引物扩增其前病毒基因组中的vif基因,对于扩增阳性的29例PCR产物进行vif区基因的测序及分析。结果29条vif基因的平均离散率是0．0328,突变主要集中于90～120、270 -302、372～405、450～470四个区域。Vif多肽链的90～93位和157～160位存在两个富含R和K带有强烈正电荷的亲水区,带正电荷的R或K交替出现,几乎没有其他的氨基酸残基。29个Vif多肽链有21条在90～93位存在R90 RKR93基序;有26条在157-160位存在K157 RRK160基序,29条序列在114位和133位存在两个在HIV-1和HIV-2以及SIV内保守的半胱氨酸(A)。结论vif在HIV-1基因组内具有相对保守性,其特征性区域和氨基酸基序对于保持Vif蛋白的功能是十分重要的。

主 题 词：人免疫缺陷病毒 vif基因 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 1007[医学-药学类] 100705[100705] 1002[医学-临床医学类] 1001[医学-基础医学] 100103[100103] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.3760/j:issn:0254-5101.2006.08.019

馆 藏 号：203481459...