基于小波包变换的多序列比对方法

作     者：谷俊峰 王希诚 赵金城 GU Jun-feng;WANG Xi-cheng;ZHAO Jin-cheng

作者机构：大连理工大学工业装备结构分析国家重点实验室辽宁大连116023 大连大学生物信息学与分子设计研究所辽宁大连116622 

基　　金：国家重点基础研究发展项目(No.2004CB518901) 国家自然科学基金重大计划资助项目(90410012) 大连理工大学研究生院博士生联合培养计划资助项目(0221) 大连大学博士生联合培养资助项目(0303023) 

出 版 物：《大连大学学报》 (Journal of Dalian University)

年 卷 期：2005年第26卷第4期

页      码：39-45页

摘      要：多序列比对是一种重要的生物信息学工具,在生物的进化分析以及蛋白质的结构预测方面有着积极的意义.以CLUSTAL W为代表的渐进式比对方法在此这个领域取得了很大的成功,但其固有的缺陷阻碍了其比对精度的进一步提高.本文提出了一种基于小波包变换的多序列比对方法,这种方法利用小波包对数字信号良好的分析能力来寻找序列之间的相似片断,从而达到提高精度、降低计算量的作用.最后,本文利用多序列比对平台BA lisBASE和仿真程序ROSE,给出了此方法与其他比对算法的效率比较结果和讨论.

主 题 词：生物信息学 多序列比对 小波包变换 BAliBASE 

学科分类：08[工学] 081202[081202] 0812[工学-测绘类] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1008-2395.2005.04.011

馆 藏 号：203494214...