多肽抑制剂抑制淀粉质多肽42构象转换的分子动力学模拟和结合自由能计算

作     者：董晓燕 都文婕 刘夫锋 

作者机构：天津大学化工学院生物工程系天津300072 天津大学系统生物工程教育部重点实验室天津300072 

基　　金：国家自然科学基金(20906068 21076149) 国家重点基础研究发展规划项目(973)(2009CB724705) 天津市科委自然科学基金(10JCYBJC04500)资助~~ 

出 版 物：《物理化学学报》 (Acta Physico-Chimica Sinica)

年 卷 期：2012年第28卷第11期

页      码：2735-2744页

摘      要：应用分子动力学模拟和结合自由能计算方法研究了多肽抑制剂KLVFF、VVIA和LPFFD抑制淀粉质多肽42(Aβ42)构象转换的分子机理.结果表明,三种多肽抑制剂均能够有效抑制Aβ42的二级结构由α-螺旋向β-折叠的构象转换.另外,多肽抑制剂降低了Aβ42分子内的疏水相互作用,减少了多肽分子内远距离的接触,有效抑制了Aβ42的疏水塌缩,从而起到稳定其初始构象的作用.这些抑制剂与Aβ42之间的疏水和静电相互作用(包括氢键)均有利于它们抑制Aβ42的构象转换.此外,抑制剂中的带电氨基酸残基可以增强其和Aβ42之间的静电相互作用(包括氢键),并降低抑制剂之间的聚集,从而大大增强对Aβ42构象转换的抑制能力.但脯氨酸的引入会破坏多肽的线性结构,从而大大降低其与Aβ42之间的作用力.上述分子模拟的结果揭示了多肽抑制剂KLVFF、VVIA和LPFFD抑制Aβ42构象转换的分子机理,对于进一步合理设计Aβ的高效短肽抑制剂具有非常重要的理论指导意义.

主 题 词：分子动力学模拟 阿尔茨海默病 淀粉质多肽 多肽抑制剂 构象转换 

学科分类：1002[医学-临床医学类] 0703[理学-化学类] 100203[100203] 0702[理学-物理学类] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.3866/PKU.WHXB201207162

馆 藏 号：203496135...