应用寡核苷酸芯片进行HLA-DQA1位点基因分型

作     者：王彤 王天骄 何群 张玉魁 马佳明 侯伟建 王绍成 潘忠诚 赵雨杰 WANG Tong;WANG Tian-Jiao;HE Qun;ZHANG Yu-Kui;MA Jia-Ming;HOU Wei-Jian;WANG Shao-Cheng;PAN Zhong-Cheng;ZHAO Yu-Jie

作者机构：沈阳医学院生化及分子生物学教研室沈阳110034 中国医科大学生物芯片中心沈阳110001 

基　　金：省自然科学基金资助项目 编号2001101001 

出 版 物：《中国实验血液学杂志》 (Journal of Experimental Hematology)

年 卷 期：2006年第14卷第1期

页      码：142-145页

摘      要：为了构建HLA-DQA1位点寡核苷酸分型芯片并籍此建立一种应用于HLA系统基因分型的集成化技术平台,在多态性集中的HLA-DQA1第二外显子区域,自行设计一套寡核苷酸分型探针;采用本实验室自建的方法,制成寡核苷酸芯片。提取的基因组DNA以组间特异性引物,单侧引物荧光标记,行不对称扩增。杂交后扫描检测分析杂交信号,确定HLA等位基因型;分型结果以标准DNA和PCR产物测序检测。结果表明:100例样本芯片分型全部成功,其中50例标准DNA与其模板相符,另50例临床样本中随机选取的10例与其测序结果相符,其中2例分型结果不完全;重复杂交实验中,位点重现率95%。结论:研制的HLA-DQA1等位基因分型芯片,其准确性和重现性理想,且操作简便、快捷,有广泛的应用前景。

主 题 词：HLA 基因分型 寡核苷酸芯片 

学科分类：1002[医学-临床医学类] 1010[医学-医学技术类] 100215[100215] 10[医学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1009-2137.2006.01.032

馆 藏 号：203501349...