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大豆疫霉多态性SSR标记开发及遗传多样性分析

大豆疫霉多态性SSR标记开发及遗传多样性分析

作     者:徐静静 王晓鸣 武小菲 朱振东 

作者机构:中国农业科学院作物科学研究所国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程北京100081 

基  金:“十一五”国家科技支撑计划(2006BAD08A08,2006BAD08A15) 国家重点基础研究发展计划“973”(2002CB111406) 公益性行业(农业)科研专项(3-20) 

出 版 物:《植物病理学报》 (Acta Phytopathologica Sinica)

年 卷 期:2009年第39卷第4期

页      码:337-346页

摘      要:用FastPCR软件在大豆疫霉全基因组中搜索到1 234个含2~4个重复基元精确SSRs。选择260个SSRs设计引物,经对大豆疫霉5个分离物的基因组DNA检测,有212对(81.5%)有效扩增出SSR特征条带,112对(52.8%)扩增多态性。用18对多态性SSR引物分析了来自美国、中国黑龙江省和福建省大豆疫霉分离物的遗传多样性,在73个分离物中共扩增出112个等位变异,变异范围为4~9,平均为6.22个,表明选择的引物对具有高的多态性。在3个大豆疫霉群体中,黑龙江省和福建省分离物的遗传距离最近,美国和福建省分离物的遗传距离最远。UPGMA聚类将73个分离物划分为6组,其中8个美国分离物(72.73%)和53个中国分离物(85.48%)被聚类在一起,表明大豆疫霉中国分离物与美国分离物可能具有共同的祖先,中国分离物可能为外来种。

主 题 词:大豆疫霉 基因组 SSR标记 遗传多样性 

学科分类:09[农学] 0904[农学-动物医学类] 090401[090401] 090402[090402] 

核心收录:

D O I:10.13926/j.cnki.apps.2009.04.001

馆 藏 号:203502619...

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