京海黄鸡翅重性状的全基因组关联分析

作     者：王文浩 张涛 张跟喜 王金玉 韩昆鹏 王永娟 WANG Wen-hao;ZHANG Tao;ZHANG Gen-xi;WANG Jin-yu;HAN Kun-peng;WANG Yong-juan

作者机构：扬州大学动物科学与技术学院江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室江苏扬州225009 江苏京海集团江苏南通226103 

基　　金：国家肉鸡产业技术体系(nycytx-42-G1-05) 江苏高校优势学科建设工程 江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室 

出 版 物：《中国畜牧杂志》 (Chinese Journal of Animal Science)

年 卷 期：2015年第51卷第5期

页      码：6-12页

摘      要：试验旨在揭示京海黄鸡翅重性状的遗传基础,寻找可用于京海黄鸡翅重性状改良的分子标记。本研究以京海黄鸡核心群母鸡为基础,测定了屠宰时的单侧翅重,利用简化基因组测序技术进行全基因组关联研究（GWAS）,检测与翅重相关的SNPs位点。结果表明：共检测到7个与翅重相关的SNPs位点,其中,rs2011502599、rsz26128672、rs1830645和rs475641139 4个SNP位点达到全基因组显著水平（P〈5.5E-07）,rs476249085、rs475679707和rs473712263 3个SNP位点达到全基因组潜在显著水平（P〈1.1E-05）;筛选每个显著SNP周围1Mb区域内的基因,共找到7个可能的候选基因,分别为PGO2、SMARCA2、ZNF302、QDPR、FBXL5、LDB2、PPARGCIA 7个基因;使用G0数据库对7个候选基因的细胞组分、分子功能和参与的生物进程进行分析发现,4个SNPs集中分布在4号染色体上的73.71~76.25Mb的区域内。表明PGO2、SMARCA2、ZNF302、QDPR、FBXL5、LDB2、PPARGC1A 7个基因和4号染色体73.71~76.25Mb区域可能为影响京海黄鸡翅重性状的重要候选基因和区域。

主 题 词：简化基因组测序 翅重 全基因组关联分析 京海黄鸡 

学科分类：090502[090502] 0905[农学-林学类] 09[农学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.0258-7033.2015.05.002

馆 藏 号：203512166...