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荧光定量PCR检测异尖线虫类病原体

荧光定量PCR检测异尖线虫类病原体

作     者:张少雷 王何兰 刘江 倪芳 徐世三 罗大民 ZHANG Shao-lei;WANG He-lan;LIU Jiang;NI Fang;XU Shi-san;LUO Da-min

作者机构:厦门大学生命科学学院厦门361005 深圳市福田人民医院体检科深圳518033 

基  金:福建省科技计划项目(No.2008N2005)~~ 

出 版 物:《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 (Chinese Journal of Parasitology and Parasitic Diseases)

年 卷 期:2010年第28卷第3期

页      码:194-199页

摘      要:目的运用荧光定量PCR法检测异尖线虫类病原体。方法于鱼类内脏中检获6种异尖线虫类幼虫:抹香鲸异尖线虫、简单异尖线虫、内弯对盲囊线虫、带鱼针蛔线虫、灰海鳗对盲囊线虫和台湾海峡鱼类中一优势种对盲囊线虫。提取各虫体DNA,PCR扩增ITS-2序列,测序并进行数据库比对。依据测序结果设计特异引物,常规PCR检验引物特异性。将ITS-2序列扩增产物回收、纯化后经T克隆转入大肠埃希菌DH5α,提取重组质粒,鉴定后作为标准品模板建立荧光定量PCR标准曲线,并做敏感性和重复性试验。结果构建的荧光定量PCR标准曲线循环阈值与模板浓度呈良好的线性关系,相关系数均在0.998以上。重复性实验中,6种虫体对应的变异系数(cv)最小值为0.18%,最大值为2.80%,试验间平均cv最小值为0.55%,最大值为1.94%,无非特异性扩增,溶解曲线的特异性和重复性良好。灵敏度实验中,可检出的最低模板浓度为1×102拷贝/μl,比常规PCR灵敏度高100倍。结论初步建立了SYBRGreenⅠ荧光定量PCR检测异尖线虫类病原体的方法 。

主 题 词:异尖线虫病 异尖线虫 ITS-2序列 荧光定量PCR SYBRGreenⅠ 

学科分类:1002[医学-临床医学类] 100201[100201] 10[医学] 

核心收录:

馆 藏 号:203518259...

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