H5N1型禽流感病毒HA基因克隆及序列分析

作     者：申燕 高冬妮 安琦 刘颖 葛菁萍 平文祥 Shen Yan;Gao Dongni;An Qi;Liu Ying;Ge Jingping;Ping Wenxiang

作者机构：黑龙江大学生命科学学院/微生物省高校重点实验室哈尔滨150080 农业微生物技术教育工程研究中心哈尔滨150080 

基　　金：国家自然科学基金"表达IBDV主要保护性抗原的重组杆状病毒构建及其作为疫苗的免疫效果研究"(31270143) 国家自然科学基金"菌群演替与温水沤麻系统关键酶产生菌代谢组学特征的耦合机制"(31270534) 黑龙江省高等学校科技创新团队"农业微生物发酵技术"(2012td009) 黑龙江大学高层次人才(创新团队)支持计划"功能微生物选育及其产物应用"(Hdtd2010-17) 

出 版 物：《中国农学通报》 (Chinese Agricultural Science Bulletin)

年 卷 期：2015年第31卷第14期

页      码：32-38页

摘      要：为从分子生物学角度进一步研究H5N1型禽流感主要抗原HA基因,探究H5N1HA基因的遗传变异情况及其蛋白结构,根据GenBank中登录的H5N1型禽流感HA基因的序列利用Primer5.0设计引物扩增HA基因,将其克隆到pMD18-T载体后进行鉴定,对鉴定正确的重组质粒pMD-H5N1-HA进行测序分析。应用生物信息学软件对禽流感病毒HA基因进行系统进化树分析、氨基酸序列同源性分析、保守区分析,磷酸化位点和序列重复区分析及HA蛋白二级、三级结构的预测。核苷酸序列测定结果表明:HA基因长1661bp,共编码326个氨基酸;生物信息学分析结果表明:HA基因在种间具有较高保守性,HA基因的氨基酸序列与其他地方性禽流感H5N1病毒株HA基因的序列同源性最高可达99.7%,且为高致病性毒株;HA蛋白的二级、三级结构预测结果显示:HA蛋白多为α螺旋和β转角结构,无规则卷曲,是亲水性蛋白。该结果为禽流感病毒的分子病毒学研究奠定了基础。

主 题 词：禽流感病毒 HA基因 序列分析 蛋白结构预测 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

馆 藏 号：203520614...