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REP-PCR分型法用于白假丝酵母菌群分析

REP-PCR分型法用于白假丝酵母菌群分析

作     者:项明洁 刘锦燕 倪培华 张华 陈华 倪语星 XIANG Mingjie;LIU Jinyan;NI Peihua;ZHANG Hua;CHEN Hua;NI Yuxing

作者机构:上海交通大学医学院附属瑞金医院卢湾分院放免检验科上海200020 上海交通大学医学院附属瑞金医院检验系上海200025 上海交通大学医学院附属瑞金医院微生物科上海200025 

基  金:上海市卫生局资助项目(2009239) 卢湾区卫生局资助项目(卢卫科08002) 

出 版 物:《检验医学》 (Laboratory Medicine)

年 卷 期:2010年第25卷第7期

页      码:524-528页

摘      要:目的运用Agilent生物分析仪对临床白假丝酵母菌进行重复序列(REP)-聚合酶链反应(PCR)分型,并分析其流行趋势。方法设计REP引物,进行PCR扩增,用DL7500 Labchip芯片在Agilent 2100生物分析仪上对产物做微流电泳,获得虚拟凝胶视图,再运用GelCompareⅡ软件对其DNA指纹图谱做聚类分析。结果白假丝酵母菌菌株指纹图谱相似度较高,>80%以上。被分析的100株临床株可分为9个基因型。结论REP-PCR的Agilent 2100同源性分析具有快速、易于操作、高重复性和高分辨率等优点,可广泛用于流行病学调查与研究。

主 题 词:白假丝酵母菌 重复序列-聚合酶链反应 Agilent2100生物分析仪 流行趋势分析 

学科分类:1010[医学-医学技术类] 10[医学] 

D O I:10.3969/j.issn.1673-8640.2010.07.007

馆 藏 号:203526490...

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