圆斑星鲽线粒体基因组全序列结构及其进化

作     者：赫崇波 高祥刚 王效敏 刘卫东 周遵春 木云雷 葛陇利 HE Chong-bo;GAO Xiang-gang;WANG Xiao-min;LIU Wei-dong;ZHOU Zun-chun;MU Yun-lei;GE Long-li

作者机构：辽宁省海洋水产科学研究院辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室 辽宁师范大学实验分析中心辽宁大连116029 大连水产学院生命科学与技术学院辽宁大连116023 

基　　金：国家自然科学基金资助项目(30571410) 国家海洋科技推进平台与运行项目(2005-2007) 

出 版 物：《中国水产科学》 (Journal of Fishery Sciences of China)

年 卷 期：2007年第14卷第4期

页      码：584-592页

摘      要：利用圆斑星鲽（Verasper variegatus Temminck et Schlegel）和相关鱼类的部分线粒体基因序列，设计出6对扩增引物，通过PCR扩增产物直接测序和引物行走（Primer walking）法测定圆斑星鲽线粒体基因组全序列，并对其进行结构与进化分析。圆斑星鲽线粒体基因组序列长17273 bp，其基因序列及构成都与其他硬骨鱼基本相同，包括37个基因（2个rRNA基因、22个tRNA基因和13个蛋白质编码基因）和2个非编码区（控制区和WANCY区）。在22个tRNA基因中，tRNA^Gln、tRNA^Ala、tRNA^Asn、tRNA^Cys、tRNA^Tyr、tRNA^Ser（第2个）、tRNA^Gln和tRNA^Pro的编码基因位于L链上，其余则位于H链上。在13个蛋白质编码基因中，除了COⅠ基因的起始密码子为GTG外，其余均以ATG为起始密码子。蛋白质编码基因包括具有完整TAA终止密码子的ND1，COⅠ，ATP8，ND4L，ND5，而其他蛋白编码基因则具有不完全终止密码子。在L链上，ND6是仅有的一个蛋白质编码基因。圆斑星蝶的控制区包含1个终止相关序列区（ETAS）、6个中央保守序列区（CSB-A、B、C、D、E、F）和3个保守序列区（CSB-1、2、3）以及长串联重复区（Tandemly repeat sequence）。用NJ法和MP法对5个目22种鱼mtDNA的13个蛋白质编码基因的氨基酸序列进行系统分析，结果显示，圆斑星蝶与石鲽关系最近，鲽形目的鲆、鲽类与鲈形目的够科（Carangidae）、鲷科（Sparidae）鱼类亲缘关系较近，而同属于鲽形目的塞内加尔鳎（Solea senegalensis）没有和任何目聚在一起，成为一个独立的分支。圆斑星蝶的基因组全序列序列已提交到GenBank，登录号为DQ403797，控制区单元型序列的GenBank登录号为BQ834444～7。[中国水产科学，2007，14（4）：584—592]

主 题 词：圆斑星鲽 线粒体基因组 控制区 系统进化 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 071002[071002] 

核心收录：

D　O　I：10.3321/j.issn:1005-8737.2007.04.009

馆 藏 号：203527657...